Доля в праве так и остается долей в праве. Порядок пользования при появлении нового сособственника так же меняется. Все шесть собственников зависят друг от друга при любых перетрубациях . И не дай бог случится конфликту или разногласиям.

"Дополнительно хочу отметить, что между собственниками определен порядок пользования домом, заверенный нотариально, но регистрации этого документа в Росреестре нет." - вы, часом, не из кривоохранительных органов, судя по стилистике "шершавого языка протокола"(с)? )))
вообще, этот документ и не должен регистрироваться в росреестре.
если часть дома имеет отдельный вход, возможно имеет смысл попытаться выделить ее в натуре. это вам надо показать конкретные документы соответствующему специалисту. тогда вы будете частично избавлены от опасений типа "и также сосед может прийти ко мне".
в принципе, если между жителями этой вороньей слободки нет ярко выраженных войн, то особо ничем такое проживание не грозит. тем более с отдельным входом. определите и переподпишете новый порядок пользования, и всё. другое дело что со сменой собственника весь порядок действительно обнуляется, но это уже издержки собственности с таким количеством долей, тут ничего не поделаешь...;
"Я правильно понимаю, что в долевой собственности формально я могу прийти к соседу и сказать что я тут буду жить, потому что в натуре ничего не выделено, и также сосед может прийти ко мне?" - чисто формально - да, можете. другое дело что на практике до такого практически не доходит. так чаще делают "профессиональные соседи", когда выдавливают содольщиков. но это актуально для квартир в мкд, а для одноэтажного дома с отдельным входом на долю - практического смысла не имеет.

А сколько же кв. м. в этом резиновом доме?